Archer és legénysége felfedezi, hogy Dr. Soong és genetikailag tökéletesített hadserege több ezer szuperhumanoid embriót nevel. A flotta parancsa szerint meg kell semmisíteniük az emberiség létét fenyegető tenyészetet, amelyet Soong évekkel ezelőtt telepített egy orvosi kutatásokra specializálódott állomásra. Archer és Trip a veszélyes embriókon kívül erősen fertőző vírusraktárt talál a kísérteties bázison.